Ausgangsversion für alle Änderungen

Grundlegende Version für alles weitere ist ​benchmark.sc11.

Roadmap

1. [Mathias] Benchmark SC'11 Tag setzen, interner Release PEPC 2.0 ^{​PEPC-2.0_internal}
   • Strip-Down, Physik-Kram rausnehmen
   • Output übernehmen
   • Memwatch raus
   • Sortierer und tree_domains aufräumen (z.B. choose_sort weg)
   • Von den Frontends gemeinsam genutzte Module/Routinen in einem Tools-Unterverzeichnis ablegen
   • LOCADDRESS() durch MPI_GET_ADDRESS() austauschen
   • unterstrich-aliase bei c-code mittels "#pragma weak slsort_keys_ = slsort_keys" realisieren wird auf OSX nicht unterstützt, jetzt durch umtauschen der unterstrichenen und nicht unterstrichenen version geloest
   • copy changes from source:/tags/benchmark-1.5.1

Basis für alle weiteren Änderungen und Entwicklungen ist ​PEPC-2.0_internal im repository-trunk.

1. [Lukas & Mathias] ScaFaCos-Version aktualisieren, FMM-Interface übernehmen
2. [Robert] Vortex-Code zurück in das SVN, wenigstens per external
   • Nur via svnadmin möglich, falls history erhalten bleiben soll (siehe ​hier) ^{source:branches/newstruct}
3. [Alle :-)] Untenstehendes Konzept intialisieren^{source:branches/newstruct}
4. [Paul] Änderungen in den Trunk übernehmen ("Retrunking"), PEPC-B aktualisieren
5. [Alle] Dokumentation, konsistentes Doxygen #30
6. [Lukas & Paul] Externe Zugriffe auf trunk/tarball ermöglichen via Anmeldung?, Bugtracking-System aufsetzen #31
7. [Lukas] JuBE-Verifikation für SC'11 bzw. Version 2.0 #32
8. [Lukas] Benchmark-Daten und -Ergebnisse auf benchmark/results #33
9. Modifikationen ^{Version 2.x}
   1. [Helge] Hilbertkurve
   2. [Helge] Branchabschätzung für die Arraygrößen nutzen
   3. [Mathias] Teilchenzahl-abhängige Allokationen innerhalb von fields, nicht innerhalb von setup
   4. [Mathias] sl_pepcparts entfernen
   5. [Lukas] Makefile parallelisieren via -j
   6. [Mathias & Lukas] Alternativen zu sqrt evaluieren: libmass etc. (siehe ​BGP-Performance) Einfaches ersetzen von -lm durch lmass bringt scheinbar nichts: Beispiel mit 2,000,000 Teilchen auf 32 Nodes JUGENE (Laufzeit in sec. fuer die jeweils ersten drei Zeitschritte):

libm:	21.4807771000	19.8667861000	19.8749619094
libmass:	21.4707042624	19.8570766153	19.8580398953
libmassv:	21.6495978106	19.8648933776	19.8754953612
libmass+qarch450d:	21.7186051141	19.9697114624	19.9818944247
libm+450d:	21.7355234271	19.9969321188	20.0118417459	#34

1. [Lukas] Erstellung der Unmenge an diagnostic files per flag abschaltbar machen (diag_XX.dat, timings_XX.dat, load_XX.dat)
2. Baumaufbau unabhaengig von gueltigen Labels machen - derzeit darf kein label == 0 sein
3. ? serial tests with jube #32
4. ? test for working MPI_IN_PLACE (during runtime) #35
5. [Mathias] test for valid pointers during runtime (aka "ifort-problem") - behoben mit ifort 12.1 (jetzt auch auf JuRoPa)
6. ? integer*8 bzw. *4 sowie Äquivalente für Real durch die kind=...-Notation ersetzen, denn die Stern-Notation ist in Fortran 2003 nicht mehr erlaubt #36
7. Zuruecksortieren der Teilchen mittels Flag deaktivierbar machen
8. [Mathias] Keine Kopien aller Daten in fields anlegen

Features auf Halde

1. Reduced trees
2. Memwatch

Gedanken, Konzepte und Visionen ^{Version 3.0}

• Neukonzeptionierung der Branches, Fortsetzen des Helge-Ansatzes (Ausquetschen vorhandener Informationen)
• Speicherstatistik reintegrieren, Memwatc portabilisieren
• Weitere Hybridisierung, z.B. Baumaufbau, Sortierer (OpenMP + Pthreads im Konflikt?)
• [Robert] Kontakt zu PKDGRAV, Ideen-Austausch möglich
• PEPC-Datenstrukturen ^{source:branches/newstruct}
  • [Lukas & Andreas] SPH: Was fehlt PEPC2 für SPH? Nachbarschaftssuche/-liste etc.
  • [Robert] Was fehlt PEPC2 für Vortex?
    • Generischer Datentyp für Partikel, u.a. mit
      • Koordinaten, Schlüssel, pid, label (?)
      • "Physikalische" Größen, z.B. Ladung, Masse, Vorticity, Geschwindigkeit
      • "Technische" Größen, z.B. Kernradius, Volumen
      • Zeitintegrator-Variablen: Historie für AB- oder RK-Methoden
    • Generischer Datentyp für Multipol-Momente bzw. Baumeigenschaften (mehrdimensionale Entwicklung, flexible Ordnung)
    • Verschiedene MACs
    • Verschiedene Summationsroutinen (z.B. mit Komponenten algebraischer Kerne)
    • Flexible workload-Definition (Schwerpunkt Kommunikation oder Rechnung)
  • [Lukas & Mathias] Hashtable-Struktur
    • Schleifen über die gesamte Hashtable vermeiden (z.B. pack) #9
  • Restrukturierung der maxleaf/maxtwig-arrays (warum wechselt eigentlich das Verhältnis) #37
• Branchlets #4
  • M Teilchen pro leaf (variabel halten)
  • Interaktion im walk zwischen branchlets, nicht mit Teilchen
  • Restrukturierung des Baumaufbaus nötig zur Bestimmung der neuen leafs

Bekannte Probleme (evtl. für die Doku)

• MPI_IN_PLACE geht mit OpenMPI auf OSX nicht: ​https://svn.open-mpi.org/trac/ompi/ticket/1982 - MPICH2 macht keine Probleme
• ifort Version 11: von C aufgerufene Fortran-Callbacks dereferenzieren Pointer-Argumente/Rückgabewerte zu oft: ​http://software.intel.com/en-us/forums/showthread.php?t=82500
• Inlining auf JUGENE funktioniert bei GetKernelProcessorID() nicht - problemlos zu umgehen, Compilerfix ist bei IBM in Entwicklung (PMR 79073,033,724)
• clock_gettime geht auf OSX nicht, benötigt für Conditional Variables in pthreads