| 1 | ! **************************************************************
|
|---|
| 2 | !
|
|---|
| 3 | ! This file contains the subroutines: opeflx,gdtflx
|
|---|
| 4 | !
|
|---|
| 5 | ! Copyright 2003-2005 Frank Eisenmenger, U.H.E. Hansmann,
|
|---|
| 6 | ! Shura Hayryan, Chin-Ku
|
|---|
| 7 | ! Copyright 2007 Frank Eisenmenger, U.H.E. Hansmann,
|
|---|
| 8 | ! Jan H. Meinke, Sandipan Mohanty
|
|---|
| 9 | !
|
|---|
| 10 | ! **************************************************************
|
|---|
| 11 |
|
|---|
| 12 | subroutine opeflx(nml)
|
|---|
| 13 |
|
|---|
| 14 | ! ......................................................................
|
|---|
| 15 | ! PURPOSE: Calculate internal energy for FLEX dataset and its partial
|
|---|
| 16 | ! derivatives vs. variables using recursive algorithm from:
|
|---|
| 17 | ! Noguti T, Go N, J Phys Soc (Japan) v52 3685-3690 1984; Abe H,
|
|---|
| 18 | ! Braun W, Noguti T, Go N, Comp Chem v8 239-247 1984; Mazur A K,
|
|---|
| 19 | ! Abagyan R A, J Biomol Struct Dyn v6 815-832, which I modified
|
|---|
| 20 | ! for atomic forces instead of simple derivatives (see Lavery R,
|
|---|
| 21 | ! Sklenar H, Zakrzewska K, Pullman B, J Biomol Struct Dyn v3
|
|---|
| 22 | ! 989-1014 1986)
|
|---|
| 23 | !
|
|---|
| 24 | ! CALLS: gdtflx
|
|---|
| 25 | ! ......................................................................
|
|---|
| 26 |
|
|---|
| 27 | include 'INCL.H'
|
|---|
| 28 |
|
|---|
| 29 | integer nml
|
|---|
| 30 |
|
|---|
| 31 | double precision enyflx
|
|---|
| 32 |
|
|---|
| 33 | integer ims, i1a, i14, i1, i, i1s, i2s, i2, i2a, j, io, ifivr
|
|---|
| 34 | integer iad, ia, ib, ic, ilavr, ijhb, iowh, it, ity, iv, ivw, jty
|
|---|
| 35 | integer jowh, lad, ntlvr
|
|---|
| 36 | double precision cqi,c, ep, e0, deyds, cqiqj, eynw, eyol, deel
|
|---|
| 37 | double precision ex, cth, dhb, deyrp, eel, eyds, ey, eyrp, ez
|
|---|
| 38 | double precision fvr, hhb, gda, gdn, vrn, p, py, px, pz, yfiv
|
|---|
| 39 |
|
|---|
| 40 | double precision rij6, rij12, rij, rij2, sr, sr2, vr, xti
|
|---|
| 41 | double precision xb, xj, xfriv, xfiv, xfi, xfji, xij, xi, xsr
|
|---|
| 42 | double precision yb, yfi, yfji, yfriv, yi, yij, yj, zfi, yti
|
|---|
| 43 | double precision zb, zfiv, zfji, zfriv, zij, zi, zj, zti, del
|
|---|
| 44 |
|
|---|
| 45 |
|
|---|
| 46 | double precision xfat, yfat, zfat, xtat, ytat, ztat, xfvr, yfvr
|
|---|
| 47 | double precision zfvr, xfrvr, yfrvr, zfrvr
|
|---|
| 48 | dimension xfat(mxat),yfat(mxat),zfat(mxat),
|
|---|
| 49 | & xtat(mxat),ytat(mxat),ztat(mxat),
|
|---|
| 50 | & xfvr(mxvr),yfvr(mxvr),zfvr(mxvr),
|
|---|
| 51 | & xfrvr(mxvr),yfrvr(mxvr),zfrvr(mxvr)
|
|---|
| 52 |
|
|---|
| 53 |
|
|---|
| 54 | eyel=0.d0
|
|---|
| 55 | eyvw=0.d0
|
|---|
| 56 | eyhb=0.d0
|
|---|
| 57 | eyvr=0.d0
|
|---|
| 58 | eysm=0.d0
|
|---|
| 59 |
|
|---|
| 60 | ntlvr=nvrml(nml)
|
|---|
| 61 | if (ntlvr.eq.0) then
|
|---|
| 62 | write (logString, '(a,i4)')
|
|---|
| 63 | & ' opeflx> No variables defined in molecule #',nml
|
|---|
| 64 | return
|
|---|
| 65 | endif
|
|---|
| 66 |
|
|---|
| 67 | ifivr=ivrml1(nml)
|
|---|
| 68 | ilavr=ifivr+ntlvr-1
|
|---|
| 69 |
|
|---|
| 70 | do i=ifivr,ilavr
|
|---|
| 71 | gdeyvr(i)=0.d0
|
|---|
| 72 | xfvr(i)=0.0
|
|---|
| 73 | yfvr(i)=0.0
|
|---|
| 74 | zfvr(i)=0.0
|
|---|
| 75 | xfrvr(i)=0.0
|
|---|
| 76 | yfrvr(i)=0.0
|
|---|
| 77 | zfrvr(i)=0.0
|
|---|
| 78 | enddo
|
|---|
| 79 |
|
|---|
| 80 | do i=iatrs1(irsml1(nml)),iatrs2(irsml2(nml))
|
|---|
| 81 | xfat(i)=0.d0
|
|---|
| 82 | yfat(i)=0.d0
|
|---|
| 83 | zfat(i)=0.d0
|
|---|
| 84 |
|
|---|
| 85 | xtat(i)=0.d0
|
|---|
| 86 | ytat(i)=0.d0
|
|---|
| 87 | ztat(i)=0.d0
|
|---|
| 88 | enddo
|
|---|
| 89 |
|
|---|
| 90 | i1s=imsml1(nml)+nmsml(nml)
|
|---|
| 91 | i1a=iadml1(nml)+nadml(nml)
|
|---|
| 92 |
|
|---|
| 93 | do io=ilavr,ifivr,-1 ! ______ loop over variables in desc. order
|
|---|
| 94 |
|
|---|
| 95 | iv=iorvr(io) ! index of var.
|
|---|
| 96 | ia=iatvr(iv) ! prim.mv.at
|
|---|
| 97 |
|
|---|
| 98 | ib=iowat(ia) ! base
|
|---|
| 99 | xb=xat(ib)
|
|---|
| 100 | yb=yat(ib)
|
|---|
| 101 | zb=zat(ib)
|
|---|
| 102 |
|
|---|
| 103 | it=ityvr(iv) ! type
|
|---|
| 104 | ic=iclvr(iv) ! class
|
|---|
| 105 |
|
|---|
| 106 | fvr=0.d0
|
|---|
| 107 |
|
|---|
| 108 | if (it.eq.3) then ! torsion
|
|---|
| 109 | ex=xtoat(ib)
|
|---|
| 110 | ey=ytoat(ib)
|
|---|
| 111 | ez=ztoat(ib)
|
|---|
| 112 |
|
|---|
| 113 | vr=toat(ia)
|
|---|
| 114 |
|
|---|
| 115 | e0=e0to(ic)
|
|---|
| 116 | if (e0.ne.0.d0) then
|
|---|
| 117 | vrn=vr*rnto(ic)
|
|---|
| 118 | eyvr=eyvr+e0*(1.d0+sgto(ic)*cos(vrn))
|
|---|
| 119 | fvr=esnto(ic)*sin(vrn)
|
|---|
| 120 | endif
|
|---|
| 121 |
|
|---|
| 122 | elseif (it.eq.2) then ! b.angle
|
|---|
| 123 | ex=xbaat(ia)
|
|---|
| 124 | ey=ybaat(ia)
|
|---|
| 125 | ez=zbaat(ia)
|
|---|
| 126 |
|
|---|
| 127 | vr=baat(ia)
|
|---|
| 128 |
|
|---|
| 129 | elseif (it.eq.1) then ! b.length
|
|---|
| 130 | ex=xtoat(ia)
|
|---|
| 131 | ey=ytoat(ia)
|
|---|
| 132 | ez=ztoat(ia)
|
|---|
| 133 |
|
|---|
| 134 | vr=blat(ia)
|
|---|
| 135 |
|
|---|
| 136 | endif
|
|---|
| 137 |
|
|---|
| 138 | ! ============================================ Energies & Atomic forces
|
|---|
| 139 |
|
|---|
| 140 | xfiv=0.d0
|
|---|
| 141 | yfiv=0.d0
|
|---|
| 142 | zfiv=0.d0
|
|---|
| 143 | xfriv=0.d0
|
|---|
| 144 | yfriv=0.d0
|
|---|
| 145 | zfriv=0.d0
|
|---|
| 146 |
|
|---|
| 147 | i2s=i1s-1 ! last m.s per 'iv'
|
|---|
| 148 | i1s=imsvr1(iv) ! 1st m.s
|
|---|
| 149 |
|
|---|
| 150 | do ims=i1s,i2s ! __ loop over m.s
|
|---|
| 151 |
|
|---|
| 152 | i1=latms1(ims)
|
|---|
| 153 | i2=latms2(ims)
|
|---|
| 154 |
|
|---|
| 155 | do i=i1,i2 ! __ loop over atoms i ===================
|
|---|
| 156 |
|
|---|
| 157 | ity=ityat(i)
|
|---|
| 158 | cqi=conv*cgat(i)
|
|---|
| 159 |
|
|---|
| 160 | xi=xat(i)
|
|---|
| 161 | yi=yat(i)
|
|---|
| 162 | zi=zat(i)
|
|---|
| 163 |
|
|---|
| 164 | xfi=xfat(i)
|
|---|
| 165 | yfi=yfat(i)
|
|---|
| 166 | zfi=zfat(i)
|
|---|
| 167 |
|
|---|
| 168 | xti=xtat(i)
|
|---|
| 169 | yti=ytat(i)
|
|---|
| 170 | zti=ztat(i)
|
|---|
| 171 |
|
|---|
| 172 | do ivw=ivwat1(i),ivwat2(i) ! loop over vdW-domains of 'i'
|
|---|
| 173 | do j=lvwat1(ivw),lvwat2(ivw) ! atoms j
|
|---|
| 174 |
|
|---|
| 175 | jty=ityat(j)
|
|---|
| 176 |
|
|---|
| 177 | xj=xat(j)
|
|---|
| 178 | yj=yat(j)
|
|---|
| 179 | zj=zat(j)
|
|---|
| 180 |
|
|---|
| 181 | xij=xj-xi
|
|---|
| 182 | yij=yj-yi
|
|---|
| 183 | zij=zj-zi
|
|---|
| 184 |
|
|---|
| 185 | rij2=xij*xij+yij*yij+zij*zij
|
|---|
| 186 | rij6=rij2**3
|
|---|
| 187 | rij12=rij6*rij6
|
|---|
| 188 | rij=sqrt(rij2)
|
|---|
| 189 |
|
|---|
| 190 | cqiqj=cqi*cgat(j)
|
|---|
| 191 |
|
|---|
| 192 | if (epsd) then
|
|---|
| 193 |
|
|---|
| 194 | sr=slp_f*rij
|
|---|
| 195 | sr2=sr*sr
|
|---|
| 196 | xsr=(plt-1.d0)*exp(-sr)/2.d0
|
|---|
| 197 | ep=plt-(sr2+2.d0*sr+2.d0)*xsr
|
|---|
| 198 |
|
|---|
| 199 | eel=cqiqj/(rij*ep)
|
|---|
| 200 | eyel=eyel+eel
|
|---|
| 201 | deel=eel+cqiqj*(slp_f*sr2*xsr)/(ep*ep)
|
|---|
| 202 |
|
|---|
| 203 | else
|
|---|
| 204 |
|
|---|
| 205 | eel=cqiqj/rij
|
|---|
| 206 | eyel=eyel+eel
|
|---|
| 207 | deel=eel
|
|---|
| 208 |
|
|---|
| 209 | endif
|
|---|
| 210 |
|
|---|
| 211 |
|
|---|
| 212 | eyrp=aij(ity,jty)/rij12
|
|---|
| 213 | eyds=cij(ity,jty)/rij6
|
|---|
| 214 |
|
|---|
| 215 | c=(-12.d0*eyrp+6.d0*eyds- deel)/rij
|
|---|
| 216 |
|
|---|
| 217 | xij=xij/rij
|
|---|
| 218 | yij=yij/rij
|
|---|
| 219 | zij=zij/rij
|
|---|
| 220 |
|
|---|
| 221 | xfji=c*xij
|
|---|
| 222 | yfji=c*yij
|
|---|
| 223 | zfji=c*zij
|
|---|
| 224 |
|
|---|
| 225 | ijhb=ihbty(ity,jty)
|
|---|
| 226 | if (ijhb.ne.0.and.rij.le.cohb) then ! HB Possible
|
|---|
| 227 | if (ijhb.gt.0) then ! i=H,j=acceptor
|
|---|
| 228 | iowh=iowat(i)
|
|---|
| 229 | px=xi-xat(iowh)
|
|---|
| 230 | py=yi-yat(iowh)
|
|---|
| 231 | pz=zi-zat(iowh)
|
|---|
| 232 | else ! i=acceptor,j=H
|
|---|
| 233 | jowh=iowat(j)
|
|---|
| 234 | px=xat(jowh)-xj
|
|---|
| 235 | py=yat(jowh)-yj
|
|---|
| 236 | pz=zat(jowh)-zj
|
|---|
| 237 | endif
|
|---|
| 238 |
|
|---|
| 239 | p=sqrt(px*px+py*py+pz*pz)
|
|---|
| 240 | px=px/p
|
|---|
| 241 | py=py/p
|
|---|
| 242 | pz=pz/p
|
|---|
| 243 |
|
|---|
| 244 | cth=xij*px+yij*py+zij*pz
|
|---|
| 245 |
|
|---|
| 246 | if (cth.gt.0.d0) then
|
|---|
| 247 |
|
|---|
| 248 | deyrp=(ahb(ity,jty)-aij(ity,jty))/rij12
|
|---|
| 249 | deyds=(chb(ity,jty)-cij(ity,jty))/rij6
|
|---|
| 250 |
|
|---|
| 251 | dhb=deyrp-deyds
|
|---|
| 252 | eyhb=eyhb+eyrp-eyds+cth*dhb
|
|---|
| 253 |
|
|---|
| 254 | if (ijhb.gt.0) then ! i=H
|
|---|
| 255 | xti=xti +dhb * (zij*py-yij*pz)
|
|---|
| 256 | yti=yti +dhb * (xij*pz-zij*px)
|
|---|
| 257 | zti=zti +dhb * (yij*px-xij*py)
|
|---|
| 258 | else ! j=H
|
|---|
| 259 | xtat(j)=xtat(j) +dhb * (zij*py-yij*pz)
|
|---|
| 260 | ytat(j)=ytat(j) +dhb * (xij*pz-zij*px)
|
|---|
| 261 | ztat(j)=ztat(j) +dhb * (yij*px-xij*py)
|
|---|
| 262 | endif
|
|---|
| 263 |
|
|---|
| 264 | dhb=dhb/rij
|
|---|
| 265 | hhb=cth*(7.d0*deyds-13.d0*deyrp)/rij
|
|---|
| 266 |
|
|---|
| 267 | xfji=xfji+ dhb*px+ hhb*xij
|
|---|
| 268 | yfji=yfji+ dhb*py+ hhb*yij
|
|---|
| 269 | zfji=zfji+ dhb*pz+ hhb*zij
|
|---|
| 270 | ! __________________________________________________ No Hydrogen Bond
|
|---|
| 271 | else
|
|---|
| 272 | eyvw=eyvw+eyrp-eyds
|
|---|
| 273 | endif
|
|---|
| 274 | else
|
|---|
| 275 | eyvw=eyvw+eyrp-eyds
|
|---|
| 276 | endif
|
|---|
| 277 |
|
|---|
| 278 | xfi=xfi+xfji
|
|---|
| 279 | yfi=yfi+yfji
|
|---|
| 280 | zfi=zfi+zfji
|
|---|
| 281 |
|
|---|
| 282 | xfat(j)=xfat(j)-xfji
|
|---|
| 283 | yfat(j)=yfat(j)-yfji
|
|---|
| 284 | zfat(j)=zfat(j)-zfji
|
|---|
| 285 |
|
|---|
| 286 | enddo ! ... atoms j
|
|---|
| 287 | enddo ! ... vdW-domains of i
|
|---|
| 288 |
|
|---|
| 289 | do i14=i14at1(i),i14at2(i) ! loop over 1-4 partn. of 'i'
|
|---|
| 290 | j=l14at(i14)
|
|---|
| 291 |
|
|---|
| 292 | jty=ityat(j)
|
|---|
| 293 |
|
|---|
| 294 | xj=xat(j)
|
|---|
| 295 | yj=yat(j)
|
|---|
| 296 | zj=zat(j)
|
|---|
| 297 |
|
|---|
| 298 | xij=xj-xi
|
|---|
| 299 | yij=yj-yi
|
|---|
| 300 | zij=zj-zi
|
|---|
| 301 |
|
|---|
| 302 | rij2=xij*xij+yij*yij+zij*zij
|
|---|
| 303 | rij6=rij2**3
|
|---|
| 304 | rij12=rij6*rij6
|
|---|
| 305 | rij=sqrt(rij2)
|
|---|
| 306 |
|
|---|
| 307 | cqiqj=cqi*cgat(j)
|
|---|
| 308 |
|
|---|
| 309 | if (epsd) then
|
|---|
| 310 |
|
|---|
| 311 | sr=slp_f*rij
|
|---|
| 312 | sr2=sr*sr
|
|---|
| 313 | xsr=(plt-1.d0)*exp(-sr)/2.d0
|
|---|
| 314 | ep=plt-(sr2+2.d0*sr+2.d0)*xsr
|
|---|
| 315 |
|
|---|
| 316 | eel=cqiqj/(rij*ep)
|
|---|
| 317 | eyel=eyel+eel
|
|---|
| 318 | deel=eel+cqiqj*(slp_f*sr2*xsr)/(ep*ep)
|
|---|
| 319 |
|
|---|
| 320 | else
|
|---|
| 321 |
|
|---|
| 322 | eel=cqiqj/rij
|
|---|
| 323 | eyel=eyel+eel
|
|---|
| 324 | deel=eel
|
|---|
| 325 |
|
|---|
| 326 | endif
|
|---|
| 327 |
|
|---|
| 328 | eyrp=a14(ity,jty)/rij12
|
|---|
| 329 | eyds=cij(ity,jty)/rij6
|
|---|
| 330 |
|
|---|
| 331 | c=(-12.d0*eyrp+6.d0*eyds- deel )/rij
|
|---|
| 332 |
|
|---|
| 333 | xij=xij/rij
|
|---|
| 334 | yij=yij/rij
|
|---|
| 335 | zij=zij/rij
|
|---|
| 336 |
|
|---|
| 337 | xfji=c*xij
|
|---|
| 338 | yfji=c*yij
|
|---|
| 339 | zfji=c*zij
|
|---|
| 340 |
|
|---|
| 341 | ijhb=ihbty(ity,jty)
|
|---|
| 342 | if (ijhb.ne.0.and.rij.le.cohb) then ! HB Possible
|
|---|
| 343 | if (ijhb.gt.0) then ! i=H,j=acceptor
|
|---|
| 344 | iowh=iowat(i)
|
|---|
| 345 | px=xi-xat(iowh)
|
|---|
| 346 | py=yi-yat(iowh)
|
|---|
| 347 | pz=zi-zat(iowh)
|
|---|
| 348 | else ! i=acceptor,j=H
|
|---|
| 349 | jowh=iowat(j)
|
|---|
| 350 | px=xat(jowh)-xj
|
|---|
| 351 | py=yat(jowh)-yj
|
|---|
| 352 | pz=zat(jowh)-zj
|
|---|
| 353 | endif
|
|---|
| 354 |
|
|---|
| 355 | p=sqrt(px*px+py*py+pz*pz)
|
|---|
| 356 | px=px/p
|
|---|
| 357 | py=py/p
|
|---|
| 358 | pz=pz/p
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|---|
| 359 |
|
|---|
| 360 | cth=xij*px+yij*py+zij*pz
|
|---|
| 361 |
|
|---|
| 362 | if (cth.gt.0.d0) then
|
|---|
| 363 |
|
|---|
| 364 | deyrp=(ahb(ity,jty)-a14(ity,jty))/rij12
|
|---|
| 365 | deyds=(chb(ity,jty)-cij(ity,jty))/rij6
|
|---|
| 366 |
|
|---|
| 367 | dhb=deyrp-deyds
|
|---|
| 368 | eyhb=eyhb+eyrp-eyds+cth*dhb
|
|---|
| 369 |
|
|---|
| 370 | if (ijhb.gt.0) then ! i=H
|
|---|
| 371 | xti=xti -dhb * (yij*pz-zij*py)
|
|---|
| 372 | yti=yti -dhb * (zij*px-xij*pz)
|
|---|
| 373 | zti=zti -dhb * (xij*py-yij*px)
|
|---|
| 374 | else ! j=H
|
|---|
| 375 | xtat(j)=xtat(j) +dhb * (yij*pz-zij*py)
|
|---|
| 376 | ytat(j)=ytat(j) +dhb * (zij*px-xij*pz)
|
|---|
| 377 | ztat(j)=ztat(j) +dhb * (xij*py-yij*px)
|
|---|
| 378 | endif
|
|---|
| 379 |
|
|---|
| 380 | dhb=dhb/rij
|
|---|
| 381 | hhb=cth*(7.d0*deyds-13.d0*deyrp)/rij
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|---|
| 382 |
|
|---|
| 383 | xfji=xfji+ dhb*px+ hhb*xij
|
|---|
| 384 | yfji=yfji+ dhb*py+ hhb*yij
|
|---|
| 385 | zfji=zfji+ dhb*pz+ hhb*zij
|
|---|
| 386 | ! __________________________________________________ No Hydrogen Bond
|
|---|
| 387 | else
|
|---|
| 388 | eyvw=eyvw+eyrp-eyds
|
|---|
| 389 | endif
|
|---|
| 390 | else
|
|---|
| 391 | eyvw=eyvw+eyrp-eyds
|
|---|
| 392 | endif
|
|---|
| 393 |
|
|---|
| 394 | xfi=xfi+xfji
|
|---|
| 395 | yfi=yfi+yfji
|
|---|
| 396 | zfi=zfi+zfji
|
|---|
| 397 |
|
|---|
| 398 | xfat(j)=xfat(j)-xfji
|
|---|
| 399 | yfat(j)=yfat(j)-yfji
|
|---|
| 400 | zfat(j)=zfat(j)-zfji
|
|---|
| 401 |
|
|---|
| 402 | enddo ! ... 1-4-partners of i
|
|---|
| 403 |
|
|---|
| 404 | xfat(i)=xfi
|
|---|
| 405 | yfat(i)=yfi
|
|---|
| 406 | zfat(i)=zfi
|
|---|
| 407 | xtat(i)=xti
|
|---|
| 408 | ytat(i)=yti
|
|---|
| 409 | ztat(i)=zti
|
|---|
| 410 |
|
|---|
| 411 | xfiv=xfiv + xfi
|
|---|
| 412 | yfiv=yfiv + yfi
|
|---|
| 413 | zfiv=zfiv + zfi
|
|---|
| 414 |
|
|---|
| 415 | xfriv=xfriv + yfi*zi-zfi*yi + xti
|
|---|
| 416 | yfriv=yfriv + zfi*xi-xfi*zi + yti
|
|---|
| 417 | zfriv=zfriv + xfi*yi-yfi*xi + zti
|
|---|
| 418 |
|
|---|
| 419 | enddo ! ... atoms i
|
|---|
| 420 | enddo ! ... m.s.
|
|---|
| 421 |
|
|---|
| 422 | i2a=i1a-1 ! last 'added' var.
|
|---|
| 423 | i1a=iadvr1(iv) ! 1st 'added' var.
|
|---|
| 424 |
|
|---|
| 425 | do iad=i1a,i2a
|
|---|
| 426 | lad=ladvr(iad)
|
|---|
| 427 | xfiv=xfiv+xfvr(lad)
|
|---|
| 428 | yfiv=yfiv+yfvr(lad)
|
|---|
| 429 | zfiv=zfiv+zfvr(lad)
|
|---|
| 430 | xfriv=xfriv+xfrvr(lad)
|
|---|
| 431 | yfriv=yfriv+yfrvr(lad)
|
|---|
| 432 | zfriv=zfriv+zfrvr(lad)
|
|---|
| 433 | enddo
|
|---|
| 434 |
|
|---|
| 435 | xfvr(iv)=xfiv
|
|---|
| 436 | yfvr(iv)=yfiv
|
|---|
| 437 | zfvr(iv)=zfiv
|
|---|
| 438 | xfrvr(iv)=xfriv
|
|---|
| 439 | yfrvr(iv)=yfriv
|
|---|
| 440 | zfrvr(iv)=zfriv
|
|---|
| 441 |
|
|---|
| 442 | if (it.eq.3.or.it.eq.2) then ! torsion,b.angle
|
|---|
| 443 |
|
|---|
| 444 | gdeyvr(iv)= (ey*zb-ez*yb)*xfiv+(ez*xb-ex*zb)*yfiv+
|
|---|
| 445 | & (ex*yb-ey*xb)*zfiv
|
|---|
| 446 | & +ex*xfriv+ey*yfriv+ez*zfriv -fvr
|
|---|
| 447 |
|
|---|
| 448 | elseif (it.eq.1) then ! b.length
|
|---|
| 449 |
|
|---|
| 450 | gdeyvr(iv)= -(ex*xfiv+ey*yfiv+ez*zfiv) -fvr
|
|---|
| 451 |
|
|---|
| 452 | endif
|
|---|
| 453 |
|
|---|
| 454 | if (tesgrd) call gdtflx(nml,iv) ! grad.-test
|
|---|
| 455 |
|
|---|
| 456 | enddo ! ... variables
|
|---|
| 457 |
|
|---|
| 458 | eysm= eyel+eyvw+eyhb+eyvr
|
|---|
| 459 |
|
|---|
| 460 | return
|
|---|
| 461 | end
|
|---|
| 462 | ! *****************************
|
|---|
| 463 | subroutine gdtflx(nml,iv)
|
|---|
| 464 |
|
|---|
| 465 | ! .....................................................................
|
|---|
| 466 | ! PURPOSE: calculate partial derivative of internal energy for molecule
|
|---|
| 467 | ! 'nml' vs. variable 'iv' NUMERICALLY and compare with
|
|---|
| 468 | ! its value obtained analytically
|
|---|
| 469 | !
|
|---|
| 470 | ! CALLS: setvar, enyflx
|
|---|
| 471 | ! .....................................................................
|
|---|
| 472 |
|
|---|
| 473 | include 'INCL.H'
|
|---|
| 474 |
|
|---|
| 475 | integer nml, iv, it, i
|
|---|
| 476 | double precision enyflx
|
|---|
| 477 |
|
|---|
| 478 | double precision del
|
|---|
| 479 | parameter (del=1.d-7)
|
|---|
| 480 |
|
|---|
| 481 | double precision eynw, eyol, gda, gdn, ovr, vlvrx
|
|---|
| 482 | dimension vlvrx(mxvr)
|
|---|
| 483 |
|
|---|
| 484 | ! ____________________________ get & save values of variables
|
|---|
| 485 | do i=1,ivrml1(ntlml)+nvrml(ntlml)-1
|
|---|
| 486 | it=ityvr(i) ! type
|
|---|
| 487 | if (it.eq.3) then ! torsion
|
|---|
| 488 | vlvrx(i)=toat(iatvr(i))
|
|---|
| 489 | elseif (it.eq.2) then ! b.angle
|
|---|
| 490 | vlvrx(i)=baat(iatvr(i))
|
|---|
| 491 | elseif (it.eq.1) then ! b.length
|
|---|
| 492 | vlvrx(i)=blat(iatvr(i))
|
|---|
| 493 | endif
|
|---|
| 494 | enddo
|
|---|
| 495 |
|
|---|
| 496 | ovr=vlvrx(iv)
|
|---|
| 497 | eyol=enyflx(nml)
|
|---|
| 498 |
|
|---|
| 499 | vlvrx(iv)=ovr+del ! change variable 'iv' by 'del'
|
|---|
| 500 | call setvar(nml,vlvrx)
|
|---|
| 501 | eynw=enyflx(nml) ! new energy
|
|---|
| 502 |
|
|---|
| 503 | gdn=(eynw-eyol)/del ! numerical derivative
|
|---|
| 504 | gda=gdeyvr(iv) ! analytical der.
|
|---|
| 505 |
|
|---|
| 506 | write (logString, '(1x,2a,2(e12.6,a))') nmvr(iv),': ',gda,' (',
|
|---|
| 507 | & abs(gda-gdn),')'
|
|---|
| 508 |
|
|---|
| 509 | ! _________________________ restore
|
|---|
| 510 | vlvrx(iv)=ovr
|
|---|
| 511 | call setvar(nml,vlvrx)
|
|---|
| 512 |
|
|---|
| 513 | return
|
|---|
| 514 | end
|
|---|
| 515 |
|
|---|
